TABLE 2.

Oligonucleotide primers used in this study

PrimerSequencea
For plasmid construction:
    omf285′-gccGGATCCttaagaagccttatgctctaa-3′
    omf1115′-gcgAAGCTTggtaaaatatacaaaagaagatttttcgaca-3′
    omf1145′-gccGAATTCatcgatatttatggaaaaga-3′
    omf1155′-gccAAGCTTgagatacttatttgtttaaat-3′
    omf1875′-gccCAATTGatcaaacagtagcaaaagtaaaggtc-3′
    omf1885′-gccAAGCTTgatatgatcggataatgagtg-3′
    omf1915′-gccGAATTCgatttgtcgcttaacggctcgtatg-3′
    omf1925′-gccAAGCTTaagctaggtattcgaccatag-3′
    omf3165′-gccAAGCTTacataaggaggaactactatgagtaaaggagaagaactt-3′
    omf3175′-gccGCATGCttatttgtatagttcatccatgcc-3′
    YVALYACECO5′-ctacGAATTCtacttaggctattgattgtttcca-3′
    YVAYLACBAM5′-actatcGGATCCttataatggattattgatgaatca-3′
For gel mobility shift assay:
    abrB-U5′-taaatatttataaaatgctgttat-3′
    abrB-L5′-aataactacacgtcctaattcatc-3′
    spoVG-U5′-gctttatgacctaattgtgt-3′
    spoVG-L5′-cgtaatcttacgtcagtaac-3′
    skf-U5′-tcagaattctaagatgtttaacccctctgga-3′
    skf-L5′-tgaggatcccctctcaatttttgcatagagt-3′
    sdp-U5′-agtctcgaattcgaagaaaaagtgaatgagctg-3′
    sdp-L5′-actacaaagcttattacagtaataattccctttttt-3′
    spoIIG-U5′-cagcaggaattcagtgatcgtccgagatgatt-3′
    spoIIG-L5′-cagcagaagctttgcctcacgctgttcccctt-3′
    spoIIE-U5′-gccgaattcgatcccctccgccgctacca-3′
    spoIIE-L5′-gccaagcttttatattcgttgcctgtcat-3′
    spoIIA-U5′-gcccaattgatcaaacagtagcaaaagtaaaggtc-3′
    spoIIA-L5′-gccaagcttgatatgatcggataatgagtg-3′
  • a Restriction endonuclease sites are shown in capital letters.