TABLE 2.

Primers used in this study

PrimerSequencea
MS-75′ CGG GGT ACC TTT TTT TTA ACA TTT GAT TTT GTA TTT AAA AAA TTT GGT GTT ACT AAA GCT TG 3′
MS-335′ CGG GGT ACC TTT TTT TTA ACA TTT GAT TAA CTA TTT AAA AAA TTT GGT GTT ACT TTT GCT TG 3′
M-6A5′ CGG GGT ACC TTT TTT TTA ACA TTT GAT TTT GTA TTT AAA AAA TTT GGT GTT ACT TTT ACT TG 3′
M-6T5′ CGG GGT ACC TTT TTT TTA ACA TTT GAT TTT GTA TTT AAA AAA TTT GGT GTT ACT TTT TCT TG 3′
M-6C5′ CGG GGT ACC TTT TTT TTA ACA TTT GAT TTT GTA TTT AAA AAA TTT GGT GTT ACT TTT CCT TG 3′
M-7A5′ CGG GGT ACC TTT TTT TTA ACA TTT GAT TTT GTA TTT AAA AAA TTT GGT GTT ACT TTA GCT TG 3′
M-7G5′ CGG GGT ACC TTT TTT TTA ACA TTT GAT TTT GTA TTT AAA AAA TTT GGT GTT ACT TTG GCT TG 3′
M-7C5′ CGG GGT ACC TTT TTT TTA ACA TTT GAT TTT GTA TTT AAA AAA TTT GGT GTT ACT TTC GCT TG 3′
M-8A5′ CGG GGT ACC TTT TTT TTA ACA TTT GAT TTT GTA TTT AAA AAA TTT GGT GTT ACT TAT GCT TG 3′
M-8G5′ CGG GGT ACC TTT TTT TTA ACA TTT GAT TTT GTA TTT AAA AAA TTT GGT GTT ACT TGT GCT TG 3′
M-8C5′ CGG GGT ACC TTT TTT TTA ACA TTT GAT TTT GTA TTT AAA AAA TTT GGT GTT ACT TCT GCT TG 3′
M-9A5′ CGG GGT ACC TTT TTT TTA ACA TTT GAT TTT GTA TTT AAA AAA TTT GGT GTT ACT ATT GCT TG 3′
M-9G5′ CGG GGT ACC TTT TTT TTA ACA TTT GAT TTT GTA TTT AAA AAA TTT GGT GTT ACT GTT GCT TG 3′
M-9C5′ CGG GGT ACC TTT TTT TTA ACA TTT GAT TTT GTA TTT AAA AAA TTT GGT GTT ACT CTT GCT TG 3′
M-10A5′ CGG GGT ACC TTT TTT TTA ACA TTT GAT TTT GTA TTT AAA AAA TTT GGT GTT ACA TTT GCT TG 3′
M-10G5′ CGG GGT ACC TTT TTT TTA ACA TTT GAT TTT GTA TTT AAA AAA TTT GGT GTT ACG TTT GCT TG 3′
M-10C5′ CGG GGT ACC TTT TTT TTA ACA TTT GAT TTT GTA TTT AAA AAA TTT GGT GTT ACC TTT GCT TG 3′
M-11A5′ CGG GGT ACC TTT TTT TTA ACA TTT GAT TTT GTA TTT AAA AAA TTT GGT GTT AAT TTT GCT TG 3′
M-11G5′ CGG GGT ACC TTT TTT TTA ACA TTT GAT TTT GTA TTT AAA AAA TTT GGT GTT AGT TTT GCT TG 3′
M-11T5′ CGG GGT ACC TTT TTT TTA ACA TTT GAT TTT GTA TTT AAA AAA TTT GGT GTT ATT TTT GCT TG 3′
M-12T5′ CGG GGT ACC TTT TTT TTA ACA TTT GAT TTT GTA TTT AAA AAA TTT GGT GTT TCT TTT GCT TG 3′
M-12G5′ CGG GGT ACC TTT TTT TTA ACA TTT GAT TTT GTA TTT AAA AAA TTT GGT GTT GCT TTT GCT TG 3′
M-12C5′ CGG GGT ACC TTT TTT TTA ACA TTT GAT TTT GTA TTT AAA AAA TTT GGT GTT CCT TTT GCT TG 3′
M-13A5′ CGG GGT ACC TTT TTT TTA ACA TTT GAT TTT GTA TTT AAA AAA TTT GGT GTA ACT TTT GCT TG 3′
M-13G5′ CGG GGT ACC TTT TTT TTA ACA TTT GAT TTT GTA TTT AAA AAA TTT GGT GTG ACT TTT GCT TG 3′
M-13C5′ CGG GGT ACC TTT TTT TTA ACA TTT GAT TTT GTA TTT AAA AAA TTT GGT GTC ACT TTT GCT TG 3′
M-33A5′ CGG GGT ACC TTT TTT TTA ACA TTT GAT TTT ATA TTT AAA AAA TTT GGT GTT ACT TTT GCT TG 3′
M-33T5′ CGG GGT ACC TTT TTT TTA ACA TTT GAT TTT TTA TTT AAA AAA TTT GGT GTT ACT TTT GCT TG 3′
M-33C5′ CGG GGT ACC TTT TTT TTA ACA TTT GAT TTT CTA TTT AAA AAA TTT GGT GTT ACT TTT GCT TG 3′
M-34A5′ CGG GGT ACC TTT TTT TTA ACA TTT GAT TTA GTA TTT AAA AAA TTT GGT GTT ACT TTT GCT TG 3′
M-34G5′ CGG GGT ACC TTT TTT TTA ACA TTT GAT TTG GTA TTT AAA AAA TTT GGT GTT ACT TTT GCT TG 3′
M-34C5′ CGG GGT ACC TTT TTT TTA ACA TTT GAT TTC GTA TTT AAA AAA TTT GGT GTT ACT TTT GCT TG 3′
M-35A5′ CGG GGT ACC TTT TTT TTA ACA TTT GAT TAT GTA TTT AAA AAA TTT GGT GTT ACT TTT GCT TG 3′
M-35G5′ CGG GGT ACC TTT TTT TTA ACA TTT GAT TGT GTA TTT AAA AAA TTT GGT GTT ACT TTT GCT TG 3′
M-35C5′ CGG GGT ACC TTT TTT TTA ACA TTT GAT TCT GTA TTT AAA AAA TTT GGT GTT ACT TTT GCT TG 3′
M-36A5′ CGG GGT ACC TTT TTT TTA ACA TTT GAT ATT GTA TTT AAA AAA TTT GGT GTT ACT TTT GCT TG 3′
M-36G5′ CGG GGT ACC TTT TTT TTA ACA TTT GAT GTT GTA TTT AAA AAA TTT GGT GTT ACT TTT GCT TG 3′
M-36C5′ CGG GGT ACC TTT TTT TTA ACA TTT GAT CTT GTA TTT AAA AAA TTT GGT GTT ACT TTT GCT TG 3′
OmpA.−545′ CGG GGT ACC TTT TTT TTA ACA TTT GAT TTT GTA TTT AAA AAA TTT GGT GTT ACT TTT GCT TG 3′
OmpA.−485′ CGG GGT ACC TTA ACA TTT GAT TTT GTA TTT AAA AAA TTT GGT GTT ACT TTT GCT TG 3′
OmpA.−325′ CGG GGT ACC TAT TTA AAA AAT TTG GTG TTA CTT TTG CTT G 3′
OmpA.−55′ CGG GGT ACC CTT GTA ATT AAC TAA ATT G 3′
S175′ CGG GGT ACC TTT TTT TTA ACA TTT GAT TTT GTA TTT AAA AAA TGG TGT TAC TTT TGC TTG 3′
S185′ CGG GGT ACC TTT TTT TTA ACA TTT GAT TTT GTA TTT AAA AAA TTG GTG TTA CTT TTG CTT G 3′
S205′ CGG GGT ACC TTT TTT TTA ACA TTT GAT TTT GTA TTT AAA AAA TTT TTG GTG TTA CTT TTG CTT G 3′
S215′ CGG GGT ACC TTT TTT TTA ACA TTT GAT TTT GTA TTT AAA AAA TTT TTT GGT GTT ACT TTT GCT TG 3′
S215′ CGG GGT ACC TTT TTT TTA ACA TTT GAT TTT GTA TTT AAA AAA TTT TTT TGG TGT TAC TTT TGC TTG 3′
S225′ CGG GGT ACC TTT TTT TTA ACA TTT GAT TTT GTA TTT AAA AAA TTT TTT TTG GTG TTA CTT TTG CTT G 3′
S235′ CGG GGT ACC TTT TTT TTA ACA TTT GAT TTT GTA TTT AAA AAA TTT TTT TTT GGT GTT ACT TTT GCT TG 3′
Random5′ CGG GGT ACC TTT TTT TTA ACA TNN NNN NTT GNN NNN NNN NNN NNN NNN NNT ANN TTT GNN NNN AAT TAA CTA AAT TG 3′
OMPAR5′ CGC GGA TCC TTG TAA ACC AAC TGA GAA ACC 3′
  • a Restriction sites used for cloning of PCR amplicons are underlined.